京都大学の奥野恭史教授らは3日、世界最高の計算速度を誇る理化学研究所のスーパーコンピューター「富岳(ふがく)」を用い、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となる物質を数十種類発見したと発表した。細胞内でウイルスの増殖を妨げる可能性がある。今後は細胞を使った実験などで効果を確かめる方針だ
理研副プログラムディレクターを務める奥野教授らは、富岳の高い計算力を使い、既存の薬剤2000種類以上を対象にシミュレーション(模擬実験)を実施した。ウイルスの増殖に関係するたんぱく質にくっつき、その働きを妨げる効果がどの程度あるかを調べた。
この結果、治療薬として有望だと考えられる数十種類を絞り込むことができた。この中には、新型コロナ向けに世界で臨床試験(治験)が進む薬剤が12種含まれていた。いずれも寄生虫の薬である「ニクロサミド」や「ニタゾキサニド」などで、ニタゾキサニドは既に米国やメキシコで治験が進行中だ。
また、日本の製薬会社が特許を持っている物質も、シミュレーションではよい結果が出たという。奥野教授は「富岳の計算でリストアップした中に、治験が進行中の薬剤が含まれていたことは、計算が正しいことを示唆している」と話す。
今後は細胞を使った実験で、薬剤の効果を詳しく調べる。製薬会社や研究者と協力し、臨床研究や治験についても検討する考えだ。
富岳はスパコンの計算速度を競う世界ランキング「トップ500」で6月に首位となった。2011年に首位だった「京(けい)」が1年かかる計算を数日でできる計算能力をもつ。当初、21年から運用する予定だったが、新型コロナ研究のために今年4月に前倒しで使い始めた。
日本経済新聞
https://www.nikkei.com/article/DGXMZO61137980T00C20A7EA5000/ >>1
これだけでもすごい実績になる
スパコンはすごい はよ駅名を京コンピューター前駅から富嶽コンピューター前駅に変更せな
>>2
失敗してるように見えるね。
数十レベルなら現状で製薬会社の持ってるアイデアリスト並みのことでしかない。 >治験が進行中の薬剤が含まれていたことは、計算が正しいことを示唆している
まあ、両方間違ってる可能性もあるけどね。
>>7
そうかな? この短期間で世界に名だたる欧米の製薬会社と同レベルなら、相当なものだよ。 すでに、効果と安全性が確立され、世界中で使用され
始めているアビガンが日本では医師の自由な裁量で
使用できない。極めて恣意的で異常な状態だ。
>>1
>また、日本の製薬会社が特許を持っている物質も
>シミュレーションではよい結果が出たという。
アビガン? 入力した計算式とデータが正しければ、正しい答えが導き出される
現段階は、検証が必要
こっちの記事も読み応えありますね。
もう家のPCでFAHぶん回さんでもいいかいね
ぼちぼち部屋も暑いし
>>15
アビガンは特許切れてる
だから中国で作ってる >>1
イベルメクチンのことだろ。 ならさっさと投与しろよ 【アアア嗚呼ッ!!それ血液型ですやん・罹りやすい病気男性編】
A型
ZOOMでチンコ出してシコる病
O型
TV電話でチンコ出してシコる病、妻DV離婚イヤ病
B型
気管支炎
AB型
脳梗塞
【うあああああ嗚呼ッ!それ血液型ですやん?・罹りやすい病気男性編】
A型
ZOOMでチンコだしてシコる病
O型
TV電話でチンコだしてシコる病、妻DV離婚イヤ病
B型
気管支炎
AB型
脳梗塞
😣
【アアア嗚呼ッ!!それ血液型ですやん・罹りやすい病気男性編】
A型
ZOOMでチンコ出してシコる病
O型
TV電話でチンコ出してシコる病、妻DV離婚イヤ病
B型
気管支炎
AB型
脳梗塞
【うあああああ嗚呼ッ!それ血液型ですやん?・罹りやすい病気男性編】
A型
ZOOMでチンコだしてシコる病
O型
TV電話でチンコだしてシコる病、妻DV離婚イヤ病
B型
気管支炎
AB型
脳梗塞
>>6
やることは決まってて、問題はうん千とかうん万対象があるからそれらの「全てで評価を行う」ことですよ。
ここは力技の世界でスーパーコンピュータが生きる。 チンパンジーはA型とO型しかいないんだよな
つまりAとOはチンパンジーが少しだけ進化した生き物という訳だわ
>>18
この計算て動力学計算ですよね??
それ自体は大昔からある方法でスーパーコンピュータで実用的にできるようになっただけだと思うんだけど、それがいつのまにやAIの手柄になるんですかね?? (´・ω・`) >>24
日本における物質特許は、富士フイルムが5年間の延長手続きを行っており、2024年まで有効。
なお、製造特許は中国国内でも有効。 >>16
富岳はスパコンじゃなくて正確にはサーバーなので、クラウドにも対応してまっせ >>7
本質を理解してないな
有効性が低そうというところまで総当たりで出来てるのがいいことなんだぞ エッ?ソウダナ・・・肩の筋肉の詳細な研究情報はあってもイイかもしれないな・・・。
編。完。
標的たんぱく質と強く結びつく薬を
抗ウイルス薬以外の既存薬も含めて調べた結果
何故か駆虫薬なんかが有効だったりする訳ね
>>34
記事書いてる記者が馬鹿だから
>>22 の記事ではおかしなこと言ってない データベース構築しときなよ
ついでに生産し続けてくれる体制もな
∇ヒャッハーー!マジそれ血液型ですやん・罹りやすい病気男性編
⬛A型男
ZOOMでチンコ出してシコる病
⬛O型男
TV電話でチンコ出してシコる病、妻DV離婚イヤ病
⬛B型男
気管支炎
⬛AB型男
脳梗塞
えっ!?マジそれ血液型ですやん?・罹りやすい病気男性編
⬛A型男
ZOOMでチンコだしてシコる病
⬛O型男
TV電話でチンコだしてシコる病、妻DV離婚イヤ病
⬛B型男
気管支炎
⬛AB型男
脳梗塞
すでに答えは出ています。
日本株BCG接種が、有効です。
ハンコ注射が有効です。
米国で、富裕層は数千ドル払って、BCG接種しています。
BCGだと儲からない製薬会社が、洗脳工作
研究費確保のYMNK教授の言動は見苦しいです。
既存薬剤の活用の利点は副作用の検討が最小限に済むことだ
何の病気、症状に使おうが副作用は同じだからね
既存薬剤を対コロナに活用できるなら、効果があるなら、とりあえず現段階ではとても有用だよ
今はとにかくスピードが大事
>>1
数十年前の巨大コンピューターのスペックがポケットに入る時代になったけど
数十年後に富岳並みのスペックがポケットに入ったりして 京で2000種1年かかってたものが、富岳では10日だって。
チューニングが終われば2日だと。
凄まじいね。
何となく正露丸が効きそうな気がするんだが・・・ダメか?
SARS-CoV-2のメインプロテアーゼ (Mpro; 3CL加水分解酵素)と
SARS-CoV-2 3CLpro というのが同じものなのかな。
だとすると、清肺排毒湯、柴葛解肌湯、小柴胡湯加桔梗石膏、などの柴胡剤といわれる
中医薬・または和漢薬が効果がある。
要は、これらに含まれる生薬の、黄芩に含まれるフラボノイドのバイカリンと
バイカレインが、結合ポケットにぴたっとはまって、盾となって防ぐことで坑ウイルス剤
となっているようだ。
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.13.038687v1.full
柴葛解肌湯は、葛根湯と小柴胡湯を併せて飲んでもほぼ同じで、スペイン風邪のときにも
この処方で治療すれば、極めて高くい効果があったという。 2月5日のニュース
https://pdbj.org/news/20200205
[wwPDB] 新型コロナウイルスプロテアーゼの構造が公開されまし ...pdbj.org › news
2020/02/04 - 新型コロナウイルス(2019-nCoVコロナウイルス)由来の3CL加水分解酵素(Mpro)の高分解能の結晶構造を、上海科技大学のRao Zihe氏とYang Haitao氏が率いる研究チームが決定しました。
5月1日に更新された記事では
新型コロナウイルスのメインプロテアーゼの構造を解析し、治験薬からその阻害剤を発見
http://crisp-bio.blog.jp/archives/22104442.html
薬剤7種類 (FDA承認薬のdisulfiramとcarmofur; 治験薬の ebselen, TDZD-8, shikonin,
tideglusib, ならびにPX-12)を同定した。
7種類の中では、セレンを帯び抗炎症・抗酸化・細胞保護活性が知られており細胞毒性も
極めて低いebselenが、最も強力な阻害剤 (IC50 0.67μM)であった。 で、2016年に
https://www.amed.go.jp/news/release_20161122.html
「重症急性呼吸器症候群(SARS)コロナウイルス[1]」の主要なペプチド結合加水分解
酵素「3CLプロテアーゼ[2]」が基質(酵素が作用する物質)を認識する際に示す新たな
アミノ酸配列特異性を発見しました。
中略
今回発見した特殊な認識様式と認識配列は、自己プロセシングの効率を低下させず、生
成される成熟型3CLプロテアーゼのC末端領域の自己阻害活性を抑制する“SARSウイル
スの巧みな戦略”であると考えられます。これを逆手にとれば、この自己プロセシング
のみに用いられるメカニズムをターゲットとする極めて特異性の高い創薬の開発が期待
できます。 これって、DNAの組み合わせをつきあわせて
タンパク質がくっつきそうなのか予想をするってこと?
とにかく、早く被験者に飲ませてテストしろや。
黒人患者が多いから、そこに投与しまくれや。
副作用でおかしくなっても、白人警官による
虐待死に比べれば全く問題ねえわ。 どんどん
人体実験に使えばヨロシ♪
>>48
数十年後と言わず、あと二十年もしたら量子コンピューターがパソコンになるんちゃう。 >>62
>だからこそ本格運用前からコロナの新薬研究とかに投入
関係ないだろw なんでもホルホルやってバカ丸出しw 世界の他のスパコンの数分の一の時間で絞り込めたのは良いね!
>>65
絞りこめたという保証はどこにあるの? 最良のものが漏れていることはないわけ? ていうか山中教授のことだったら
「ああ、やっぱりネトウヨかw」ということにしかならないんだけどw
(またいつものBCG脳だし、そうなんだろうw)
安倍
今年中にワクチン完成!
来春世界の皆さん接種!
7月完全な形で五輪開催!
↑
また口だけ。
>>62
クラウドに対応しているということに驚いたのではなく、スパコンでなくサーバなので、クラウドに対応できたというところに、反応しただけです。どーでもいいことですけど。 >>9
短期間?
そもそも0から作ったわけでもないのに。
>>29
バカにはそれすらわらんか?
>>38
本質は数千億かけて、目に見える成果はゼロだということだ。
わかるか?間抜け。 >>62
仮想OSなんてできて当たり前だ間抜け。
何を当たり前のことに感動してるんだか。 まあこの手の新薬の候補を100造ってみても、そのうち1つすら実用に市場に出せる
段階にはたどりつかないんだよ。仮にターゲットの細菌とかウィルスには極めて
有効でも、正常な機関や組織に害をもたらしたり、後遺症が生じたり、ショック
を起こしたり、依存性が出てやめられなくなって早死にしたり、たちまちターゲット
が耐性を獲得したりするようだと、没にせざるを得なくなる。
だから、万に一つもあたらない。土中の細菌の出す物質を片っ端から
スクリーニング試験してみる方が良いぐらいじゃないのか?
要するにスパコンで絞り込んでも「結局、人体実験しなきゃわからないw」ってことじゃん?
治験にどれくらいの日数かかるか判ってないんじゃない?
この危機下に悠長なことよw
今のスパコン絞込みってのは、ヘタな鉄砲状態だな
「提案するだけで、実行は貴方ですよ、このレポートに責任は取りませんw
使えなくても損害賠償請求できませんからw」状況
提案するのはわずかの時間かもしれんが、人間が膨大な時間かけて実行して、
提案の中のまぐれあたりに期待するほかない
数千億もかけても効果が薄い
もう数千億かけて治験までスパコンでやって
人の手を介在しないで完結してくれるレベルまでいけばいいのかもだがね
>>77
>だから、万に一つもあたらない。土中の細菌の出す物質を片っ端からスクリーニング試験してみる方が良いぐらいじゃないのか?
数十日で候補があがり、その後治験というのはわかるよ。
じゃあ「片っ端からスクリーニング試験」にはどれくらいかかるのかな。
>>78
>要するにスパコンで絞り込んでも「結局、人体実験しなきゃわからないw」ってことじゃん?
その通り。
じゃあ、従来の方法で絞り込むのに、コストと時間はスパコンいらないレベルなのかな? 初めて効くかも、って言われたシクレソニドが3/3に報告上がってたから1月とかに富嶽があったならある程度有効に使えたんじゃね?
次回以降に期待だな
極めて有効なのなら、各製薬会社が自前で大規模サーバーマシンをたくさん
秘密裏に購入して、警戒厳重な場所に置いて、延々と電気を食わせて
候補となる物質を探させれば良いだけのこと。税金を使って製薬会社に
ただで情報を提供する必要は無いだろうに。F社もマシンが沢山製薬会社に
売れたらうれしかろう。
>>81
国策だから。
民間企業に何か恨みでも?w 候補化合物からの開発費用だってただじゃないんだぞ
すでにある化合物が有望ってデータが出て開発の後押しになるなら
それは国益になるから そもそも医薬品ってそういうところあるき
オーファンドラッグの開発に金出したり候補企業募ったりとか
>>83
税金の使い方としては、おれは真っ当だと思うよ。
だいたいそんなに使ってないだろw
理研と富岳動かしたって数億円で済むと思う(適当だけどw)。
ご不満なら、お前さんは何に使う?
たぶん国民に配れと言うのかなw
こないだの10万円、いくらかかったと思う?w
それと、民間が富岳レベルを導入するのにいくらかかって、どれだけの時間がかかるか考えた?
いいよ、5年かかって企業財政ボロボロにするなら。
もう少し現実的に考えなよ。 富嶽で日本社会の格差問題の解決もできるだろ?
さっさとBI導入しろよ
>>77
まず最初に言っておくと新薬じゃない
日本語読めない人は話に入るなよ たとえば、あらかじめ実際の物質実験によって
ターゲットと親和性の高い物質をいくつか見つけておく。
そうして、そのような実験結果が既に存在することを伏せて置いて、
それらを含めておいて多数の物質を計算機シミュレーションで計算して、
それらを「発見」する。
そうして実験結果を付けて、実験で確かめたら確かにその通りだった!
といった具合にものごとの順序を逆にすると、コンピュータによる計算は
とても予言力があるんだということを宣伝できる。
そういうことをしていないかどうかは第三者にはわからないからな。
そういうことでなければ良いがね。
こういうやつを治す薬の優先順位は著しく低いだろうからどうしようもないね
>>50
京で開発したアプリを富岳に移すだけだ性能が出ないというトホホな実情だね。
しかもチューニングあり、なしでは5倍も違うと。
使いやすいスパコンっていうサギ宣伝にだまされてるなw >>89
実験結果が予想と合致しなかったらどうすんだよ
実験結果を捏造すんのか?
どういうプログラムなのかな?
誰も指摘しえなかった、思いもよらないものが出て初めて評価される。
多くの業界人があれなら効くかもって思ってるモンばっかりじゃ、
無駄に電気遣っただけってこと。
>>93
実験結果にあうようにパラメータをちょこちょこっと変えて、
従来予測が困難だったものが予測可能となった!!! とどや顔で宣伝するだけw >>89
そもそも量が多すぎて物質実験で見つけるのが難しいっていう話なんじゃないかな >>97
だからといってやみくもに数値実験したわけでもないだろ?
それなりの方向と思われるものを2000種ぐらいピックアップして、その中から数十種類を選んだってわけでしょ。
問題は、
(1) その数十種も、まあそうなるよね、ってものなかのか
(2) その数十種の中に、本当の最適種が含まれているのか(漏れはないのか)
ってことなんだろうけど、ただただ、富岳すごいでホルホルしたいだけの記事でそういった情報がまったくないw >>93
>>>89
>実験結果が予想と合致しなかったらどうすんだよ
>実験結果を捏造すんのか?
そういうときは、計算の候補から取り除いて、握り潰して
計算で予測を最初からしていないことにすればいいのさ。
そうすれば、実験との比較も載らない。
もちろんこれも、(不公正な)トリックになる。 >>100
捏造すればすごい論文が書けるとドヤ顔で
言える根性に感心するよ >>51
フリスク舐めてると予防に効きそうな気はするw >>98
闇雲にってなんだよスパコン舐めすぎ
人間が絞らずに総当たりでやってるわ
ビッグデータとか騒がれてる時代に人間が絞ってやるなんてアホなことやるわけないだろ 計算結果が実験結果と良く合うときにだけ論文を書き、
計算結果が実験結果と良く合っている論文だけが受理される。
後日、実験結果が訂正されて大きく狂ったら大恥だけれども、
それはそれで、またその結果に合うような理論補正を入れて
結果があった時だけ、論文にして投稿する。そういうものらしい。
>>105
自分がインチキクズ野郎だからと
他人もクズだと決めつけないように >>104
たった2000種が総当たりwww
おまえのバカっぷりがよくわかるわ >>107
どうしたらこんなバカさらして恥ずかしくないのか謎の >>109
化合物と医薬品が同じものという理解ならそうなるのもしょうがないね
今回はスピードが求められるわけでドラッグリポジショニングを
やろうって話なのにまだ医薬品としての承認も受けてない化合物含まれた
3000万種の話を持ってくるのはいったいどうしたことだろうと思った
医薬品と名前のついたものだけをセレクションしたんだろw
っていう反論をするならもう何も言えることはないが >>110
>医薬品と名前のついたものだけをセレクション
だから、それのどこが総当たりだっていってるわけだw たかだか2000種がビックデータwww
アホの世界ではそうなんだろうなw
やたら批判的な人ってどんな人なんだろうな
自国でスパコン作れない国の人かな
■韓国 3台
18位 ヌリオン(米国クレイ社制) 1秒間に1京3929兆回の計算
139位 ヌリ(米国クレイ社製) 1秒間に2395兆回の計算
140位 ミリ(米国クレイ社製) 1秒間に2395兆回の計算
たかが2000種でスパコンなめるなだってさwwww
アホの中ではすごいんだろうなwww
今後どんなウイルスにも応用ができるんだから
製薬会社よりスパコンのほうが上だわ
>>74
国産スパコンのスレとなると、こういう発狂するのが常駐するんだよな >>44
分子構造自体はデータベース化されてる
対象が変われば振る舞いも変わるのだから、あとはそれに応じて今回のように高速なシミュレーションを走らせるんだよ 生まれつきある種の細菌とかウィルスに耐性を持っているのだとしたら、
それはDNAに書き込まれた情報を使って、細胞内にある種のペプチドや
RNAが作られていて、細胞内に侵入したウィルスの酵素やRNA/DNAなどと
相補的に結合して増殖を抑制・制御できるようになっているからかもしれない。
あるいは、生まれつきそのような細菌やウィルスに対する抗体の設計図が
動物のDNAに存在して、それに基づいて切り貼りをして抗体が作られる
からかもしれない。ジャンク領域と言われている箇所が怪しい。
うまく、細菌あるいはウィルスを制御して、飼い慣らすことにより、
細胞内器官のようにその機能だけを上手く使って必要な栄養素を得たり
(たとえば腸内細菌など)、あるいは飼い慣らして宿主は耐性を得ているが、
その宿主の天敵に対しては強い病原性をもたらすのだとすれば、種として
外敵に対する防衛機能をもたらすことになる。